2016年9月20日，鷹君藥業榮獲“廈門市最具影響力優秀民營科技企業”稱號，廈門市僅15家企業獲此殊榮。近年來，鷹君藥業加大科研投入，先后與廈門大學藥學院、福建農林大學作物科學學院、福建師范大學生命科學學院、福建省農科院、浙江省農科院和福建亞熱帶植物研究所等“五院一所”進行產學研合作，取得了23項國家專利，先后被評為國家高新技術企業、國家知識產權優勢企業等。